菖蒲藥用有石菖蒲和九節菖蒲兩種。石菖蒲因其屬于蒲類，綠葉昌盛，生于石旁而得名。九節菖蒲則屬于另一種草本植物，古代文獻稱“一寸九節者良”。

　　石菖蒲：又名水劍草、水蜈蚣、山菖蒲。為天南星科植物石菖蒲的根莖。其性味辛、苦，微溫。能祛濕化痰、芳香開竅、和胃安神。主治痰濕蒙蔽清竅、神昏譫語、憂郁健忘、氣閉耳聾、心胸煩悶、神志不寧、胃脘腹痛、噤口痢疾等。凡陰虛陽亢者忌服。藥理證實石菖蒲有鎮靜及抗驚厥、促進消化液的分泌、抑制胃腸異常發酵、弛緩腸管平滑肌痙攣、擴張支氣管、鎮咳平喘祛痰，強身益智和增強腦區域性代謝功能的作用，對致病性皮膚真菌有抑制作用。

　　九節菖蒲：又名小菖蒲、京菖蒲、節菖蒲，為毛茛科植物阿爾泰銀蓮花之根莖。其性味辛，微溫。能溫化痰濕、開竅醒神、和中開胃。主治熱病神昏譫語、癲癇痰厥、多夢健忘、脘腹痞滿、嘔吐惡心等。

　　藥性比較：兩藥均有開竅醒神、和中開胃的作用;而石菖蒲偏于化痰安神，九節菖蒲偏于溫化痰濕，可以替代應用。