哪個RBP結合了我的ncRNA

搜這個頗具爭議的HOTAIR，詳見論文重復再起波瀾丨那些年，熱門的LncRNA（HOTAIR）真的重要嗎？

我們還是看哪個RBP結合了HOTAIR吧！

還能看到RBP上其他層面的信息

例如SNP

例如m6A修飾位點

這個RBP調控了哪些RNA？

上面是針對某一個RNA，找哪個蛋白調控了RNA。

相反的方向，圍繞RBP，查詢某個RBP調控了哪些RNA。點擊P，search RBP，包括了ENCODE的eCLIP-seq數據和其他已發表的PAR-CLIP、HITS-CLIP、iCLIP和PIP-seq數據。

例如查詢RBP TAF15

在ENCODE的eCLIP-seq數據中，發現TAF15靶向如下基因的RNA

TAF15調控的基因富集在哪些GO生物學過程和KEGG pathway。

鑒于help里對GO和KEGG版本的描述，建議下載靶基因列表，用注釋最新的clusterProfiler做富集分析，詳見：富集分析，倆人做的結果差5歲 | 你用的注釋文件有多老？

清華大學魯志組今年年初發表POSTAR，9月份又發表一個工具RBPgroup。詳見：清華大學魯志課題組在《Genome Biology》發表論文 開發了用于研究RNA及多個結合蛋白相互作用的生物信息學方法——細胞

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