
RNA按照能否編碼蛋白可分為:編碼蛋白的RNA和非編碼RNA。(百度百科:RNA可根據結構和功能的不同分為信使RNA和非編碼RNA。) 我們之前高中階段學到的信使RNA(mRNA)、轉運RNA(tRNA)和核糖體RNA(rRNA)三種RNA僅為在蛋白質的合成過程中起著明顯作用的RNA。其中mRNA便是編碼蛋白的RNA,tRNA和rRNA便是非編碼RNA。然而還有許多非編碼RNA也有重要作用并未被確證并寫進高中課本中,如今天提及的非編碼RNA。 非編碼RNA又可以分為結構性的ncRNA以及調控性的ncRNA。 對于結構性的ncRNA。就是常規參與到整個常規的翻譯過程當中,屬于正常的過程,包括tRNA和rRNA。 目前研究的主要關注點還是在于調控性的ncRNA,按照核苷酸鏈的長度可以將調控性的非編碼RNA分為小、中和長非編碼RNA。 小非編碼RNA:miRNA,piRNA,siRNA,cisRNA,telsRNA被認為是短的非編碼RNA,大小在20-50個核苷酸之間。 miRNA(microRNA):是一個長度差不多22nt的核苷酸序列。它的主要功能是通過在轉錄過程中通過堿基互補配對來降低mRNA的表達。研究熱點! piRNA(PIWI-inteeracting RNA):是一種長25-33nt的ncRNA。piRNA通過與piwi亞家族Argonaute蛋白質形成RNA-蛋白質復合物而發揮作用。這些piRNA復合體轉錄后調控以及表觀遺傳調控。研究熱點! 小干擾RNA(siRNA):主要參與RNA的沉默。在基礎實驗當中,通過構建某一個基因互補的siRNA,達到敲低基因表達的作用。不過隨著CRISPR的出現,好多基礎使用都有CRISPR來替代了siRNA的干擾了。熱度下降! crasiRNA 和 telsRNAs:相關的研究挺少的。crasiRNA是一類著絲點相互作用的ncRNA。而telsRNA則是和端粒存在相互作用的RNA。研究較少!
中等長度非編碼RNA:snoRNA,tiRNA,snRNA,scRNA,PROMPTs等被歸類為中等長度的非編碼RNA,大小在50-200個核苷酸之間。 核仁RNA(small nucleolar RNA, snoRNA):是一類小RNA分子,主要指導其他RNA(核糖體RNA,轉移RNA和小核RNA)的化學修飾。snoRNA主要分為兩類,與甲基化相關的C / D盒snoRNA和與偽尿苷化相關的H / ACA盒snoRNA。研究熱度一般! 小核RNA(small nuclear RNA, snRNA):是一類小RNA分子,它們被RNA聚合酶II或RNA聚合酶III轉錄產生的。它們的主要功能是處理細胞核中的信使前RNA(hnRNA)。研究不溫不火! 小細胞質RNA(small cytoplasmic RNA, scRNA):位于細胞質當中的一類小RNA。研究較少! 啟動子上游轉錄物(Promoter upstream transcripts, PROMPTs):是一類由反向鏈沿雙向轉錄產生的長度不一的非編碼RNA。大多數的PROMPTs在產生之后就迅速被降解,但是有某些PROMPT的表達在應激條件下會發生變化。研究較少!
長鏈非編碼RNA:一類具有最大調控效力且包含200個以上核苷酸的RNA被分類為長非編碼RNA。 其他RNA: circRNA:我們通常研究的基因都是線性結構的,基因的轉錄和翻譯都是從5'-3'的方向進行的。與線性RNA不同,環狀RNA(circRNA)形成一個共價閉合的連續環。在環狀RNA中,通常存在于RNA分子中的3'和5'末端已連接在一起的情況。對于circRNA而言,有一部分是存在編碼蛋白的功能的,但是有一些也是非編碼的,其形式基因調節功能。研究熱點! tRNA衍生片段(tRNA-derived fragments, tRFs):是由tRNA降解形成的成一些非編碼的小片段。這類片段也會發揮出和其他ncRNA一樣的調節功能。逐年遞增,但未像lncRNA井噴增長!
lncRNA和miRNA是研究熱點,發表文章較多!其他的相對來說還是少一些。相對來說比較新一些的類似circRNA, tRFs以及piRNA文章發表相對來說還算少,且也是近十年剛剛開始研究的。 1.ncRNA分類及文章發表統計-- 醫學數據庫百科 2.Dahariya S, Paddibhatla I, Kumar S, Raghuwanshi S, Pallepati A, Gutti RK. Long non-coding RNA: Classification, biogenesis and functions in blood cells. Mol Immunol. 2019 Aug;112:82-92. doi: 10.1016/j.molimm.2019.04.011. Epub 2019 May 9. PMID: 31079005.
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