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微塑料作為一類新污染物，其廣泛存在于水體、土壤和大氣等環境介質中，并對生態安全和人體健康造成潛在威脅。環境介質中微塑料可通過細菌、真菌和放線菌等微生物進行降解。研究表明，環境介質中分離出的細菌類微生物均具有降解微塑料的能力，主要包括芽孢桿菌菌屬、假單胞菌屬、克雷伯氏菌屬、不動桿菌屬等。此外，真菌也參與微塑料的降解過程，主要包括曲霉屬、枝孢霉屬、鐮孢屬、青霉屬、黃孢原毛平革菌屬等。 在基因組水平上挖掘塑料降解關鍵基因，揭示微生物在塑料降解過程中的遺傳機制和關鍵酶的功能。這些信息有助于改進微生物的降解效率，為未來生態保護提供新的思路，也為應對全球塑料污染問題提供了切實可行的解決方案。 例如，發表在《Science of the Total Environment》上一篇文章，對土壤微塑料中分離出的2株新型降解菌進行了全基因組測序分析，其中一株菌的基因組通過功能注釋分析表明有20個與塑料降解相關的代謝途徑，總共涉及266個基因，進一步識別相關酶并闡明單菌塑料降解潛在途徑。該結果表明，在基因組層面上挖掘關鍵基因，解析微生物塑料降解機制是一種可靠性的研究策略。
凌恩微生物基因組注釋解決方案 凌恩微生物小基因組注釋方案升級啦！特別推出塑料降解基因相關數據庫——RemeDB數據庫（https://niot.res.in/Remedb/）注釋分析！
RemeDB旨在助力科研人員進一步挖掘塑料降解關鍵基因。該數據庫從各種文獻資料中整理出了一個由3萬個經證實可降解主要污染物的序列組成的序列數據庫，構成了PDEs的數據庫。該注釋結果主要分為三大類，包括碳氫化合物降解酶、塑料降解酶和染料降解酶。具體列表如下：
關注微生物基因組及塑料降解基因相關研究的老師，歡迎評論區留言，凌恩竭誠為您的科研服務，助力您的科研成功！ 參考文獻 Direct evidence for selective microbial enrichment with plastic degradation potential in the plastisphere. Science of the Total Environment, 2024. 相關閱讀： |
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