此時，玄武門外早已人喊馬嘶，原來是東宮的大將馮翊、馮立，齊府的將軍薛萬徹、謝叔方率精兵兩千多人正在攻打大門。李世民的心腹力士張公瑾見援軍沖來，急中生智，奮力將玄武門關閉。援軍無法沖入門內。守衛玄武門的敬君弘、呂世衡兩位將軍挺身出戰，先后戰死。薛萬徹等見一時無法攻入，便號令所部向秦王府進軍。正當萬分緊急的時候，尉遲敬德提著李建成和李元吉的人頭趕來，大喊道：“奉圣旨討伐二賊，你們看，這就是他們的首級，你們還為誰賣命？”眾人見主人已死，立時一哄而散。

三兄弟火并的時候，李淵正帶著大臣、妃子在海池中乘船游玩，忽見一個全副披掛的將軍匆匆趕來。李淵大驚，忙問：“來者何人？”

只見那位將軍跪在地上說道：“臣尉遲敬德前來見駕。”

李淵又問：“你來此何事？”

尉遲敬德道：“太子、齊王作亂，秦王已將其誅滅，恐怕驚動陛下，特命臣前來護駕！”在場的人一聽這個消息全都驚呆了，好半天都沒反應過來。

過了好一會兒，李淵才喃喃問道：“建成、元吉都死了嗎？”

尉遲敬德答道：“是。”

兩行熱淚順著李淵的眼角流了下來，他凄然說道：“不料手足相殘之事終見于本朝。”

侍從在側的大臣蕭瑀、陳叔達對視一眼，相繼勸道：“建成、元吉本不是晉陽舉兵的首謀，又無功于天下，卻嫉恨秦王的功勞，共同策動奸謀叛亂，罪當如此。秦王不只功蓋宇宙，威揚四海，且向以仁孝著聞，既可輔佐陛下之大業，也可承歡于膝前，陛下您可以放心了。”

生米已經做成熟飯，人死不能復生，再說還有一個赳赳武夫虎視眈眈地守在面前，李淵也便不再說什么，只宣李世民上殿。李世民上殿后撲在父親懷里痛哭，弄得李淵反而倒過來安慰他一番。

斬草務須除根，李世民自然也不會手軟。他將李建成的五個兒子、李元吉的五個兒子全部殺死，并取消了他們的宗籍。

三天以后，李淵被迫宣布立秦王李世民為太子，國家大事一律由太子處理。這年八月，李淵被迫讓位，自稱太上皇。李世民當上了皇帝，他就是唐太宗。第二年，改年號為貞觀。歷史上把這次政變叫做“玄武門之變”。

玄武門之變，李世民當時可是破釜沉舟，將自己的佩刀給了尉遲恭，命他拿著片刀去請房\長孫等人過來，說若不來就亂刀砍死，是此房等人覺得左右是個死（李淵不準他們去李世民那，也說了：去就亂刀砍死他們）。

據說事變之前，李世民心里也很沒底，猶豫不決，尉遲恭哭著勸了好久（你若不殺你兄弟，偶們都死定了）才答應，個人認為玄武門之變不能完全說是李世民自己的想法，更多的應該是以李世民為首的天策集團整個團體的想法，李世民垮了很多人也沒好果子吃。

應該是李世民本身有強烈的野心，他后來的殺死兄弟的行為，應該是在外部和內部環境的逐漸逼迫下，徹底點燃自己的野心（早就有了，只是以前還沒到逼他采取激烈手段的時候罷了），且出生顯赫貴族家庭的他，應該是對家族權利爭奪見多了，一想到失敗的下場，就更促使他心一橫，豁出去干了玄武門這一票。

玄武門之變以后，東宮和齊府的文武官員紛紛逃離京城。太子東宮魏征曾勸說李建成早日除掉李世民，此時又沒有逃跑，被士兵們抓住，押到李世民面前。李世民見魏征毫無懼色，厲聲喝道：“魏征，你知罪嗎？”魏征坦然答道：“身為臣子，為主擔憂，何罪之有？遺憾的是，太子沒有聽從我的話。否則，就不會有這樣的結局了。”秦王府驍將程知節跳上一步，吼道：“死到臨頭，尚說屁話，你……”魏征微微一笑，打斷程知節的話，說道：“今日來此，只求一死。”

李世民被魏征的凜然之氣感動了。他走下座位，拍著魏征的肩膀說：“過去的事就算了。我拜你為朝廷的諫議大夫，以后就跟在我的身邊吧。我有很多缺點需要你這樣的人指正呢！”

士為知己者死。魏征也被李世民的大度和至誠感動了。他熱淚盈眶，激動地說：“殿下！只寬宥臣一人是不行的，太子和齊王的部下多著呢。”李世民當即答道：“你說得很對。現在我就任你為特使，去宣布朝廷的旨意，對他們既往不咎，全部赦免。”

此時，李建成和李元吉的部下大都逃亡山東，準備起事。魏征手捧赦旨來到，沒動一刀一槍，便平定了可能發生的叛亂。

玄武門之變作為統治階級的內部斗爭，只是赤裸裸的權力爭奪和毫無人性的血腥屠殺，本身并沒有什么積極意義。然而，這場暴力爭奪客觀上的積極意義卻是不容抹煞的。李世民踏著兄弟的尸體登上至尊的寶座之后，進行政治改革，知人善任，嚴格執法，輕徭薄賦，銳意經史，發展學校，完善科舉，開創了中國封建社會少有的開明政治———貞觀之治，從而名耀青史。而玄武門———這座唐代宮城的普通城門，也因此而名傳千古。