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易基因:Target-BS技術揭示糖尿病引發勃起功能障礙的DNA甲基化調控機制:項目文章

 深圳易基因科技 2025-04-29 發布于廣東

大家好,這里是專注表觀組學十余年,領跑多組學科研服務的易基因。

勃起功能障礙(Erectile Dysfunction, ED)是指男性無法獲得或維持足夠完成性行為的勃起能力。全球有超過1.5億男性患有ED,預計到2025年患者數量可能超過3.2億。ED的常見病因包括衰老、糖尿病和心血管疾病。目前,磷酸二酯酶5抑制劑(PDE5Is)是治療ED的一線藥物,但約35%的患者對其無效。研究表明,DNA甲基化是一種通過DNA甲基轉移酶(DNMT)作用而不改變DNA序列的化學修飾,能夠調控基因表達。eNOS(內皮型一氧化氮合酶)甲基化可抑制其表達,進而導致內皮功能障礙。然而,目前尚不清楚低雄激素水平和1型糖尿病是否通過甲基化eNOS啟動子區域來引發ED。

近日,西南醫科大學附屬醫院王娜醫生為第一作者、姜睿教授為通訊作者,在《Andrology》(IF 4.5/Q2)雜志發表了題為《Methylation of eNOS in the rat penile corpus cavernosum under different pathological states and its relationship with erectile function》的科研成果。研究探討了1型糖尿病和低雄激素狀態對大鼠陰莖海綿體組織中eNOS基因啟動子區域甲基化水平的影響及其與勃起功能的關系。研究結果為基于不同病因的ED個體化治療方案提供理論依據。易基因科技為本研究提供所需的eNOS啟動子DNA甲基化測序(Target-BS)技術服務

本研究將58只8周齡雄性Sprague-Dawley大鼠隨機分為6組(每組6只):假手術組、去勢組、去勢+睪酮(cast+T)組、正常血糖組、糖尿病組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑(5-aza-dc,1.5 mg/kg)組。在假手術組、去勢組和去勢+睪酮替代組中,術后4周檢測最大海綿體壓力/平均動脈壓(ICPmax/MAP)、血清睪酮(T)、一氧化氮(NO)濃度、DNMT1、DNMT3a、DNMT3b和eNOS的表達以及大鼠陰莖海綿體中eNOS啟動子區域的甲基化水平。在正常血糖組、糖尿病組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組中,使用甲基轉移酶抑制劑6周后進行上述檢測。

分析結果揭示了去勢組大鼠的ICPmax/MAP、DNMT1、DNMT3a、DNMT3b、eNOS和NO水平顯著低于假手術組和去勢+睪酮組。糖尿病組大鼠的ICPmax/MAP、eNOS和NO水平較低,而DNMT1、DNMT3a和DNMT3b的表達水平顯著高于正常血糖組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組。去勢組大鼠陰莖海綿體中eNOS啟動子區域的甲基化水平與假手術組或睪酮替代組之間無顯著差異。糖尿病組大鼠陰莖海綿體中eNOS啟動子區域的甲基化水平顯著高于正常血糖組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組。

研究結果表明,盡管低雄激素狀態抑制了大鼠陰莖海綿體組織中甲基轉移酶的水平,但并未影響eNOS啟動子區域的甲基化水平。高血糖通過上調陰莖海綿體組織中甲基轉移酶的水平和eNOS啟動子區域的甲基化水平,抑制了陰莖海綿體組織中NO的水平和大鼠的勃起功能。甲基轉移酶抑制劑可以部分改善1型糖尿病大鼠的勃起功能。

研究方法

實驗動物與分組:58只8周齡雄性Sprague-Dawley大鼠隨機分為6組(每組6只):假手術組、去勢組、去勢+睪酮替代組、正常血糖組、糖尿病組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑(5-aza-dc)組。

勃起功能檢測:通過測量最大海綿體壓力/平均動脈壓(ICPmax/MAP)評估勃起功能。

組織學檢測:采用免疫組化和Western blot檢測DNMT1、DNMT3a、DNMT3b和eNOS的表達。

NO濃度檢測:采用比色法測定海綿體組織中一氧化氮(NO)濃度。

DNA甲基化測序:采用靶基因DNA甲基化測序(Target-BS)技術檢測eNOS啟動子區域的甲基化水平。

研究結果

(1)體重、ICPmax/MAP、血糖和血清睪酮

體重:糖尿病組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組大鼠體重顯著低于正常血糖組,而假手術組、去勢組和去勢+睪酮替代組之間無顯著差異。

ICPmax/MAP:去勢組大鼠在3V和5V電刺激下的ICPmax/MAP顯著低于假手術組和去勢+睪酮替代組。糖尿病組的ICPmax/MAP顯著低于正常血糖組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組。

血糖:糖尿病組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組血糖顯著高于正常血糖組。

血清睪酮:去勢組血清睪酮水平顯著低于假手術組和去勢+睪酮替代組,而糖尿病組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組與正常血糖組之間無顯著差異。

圖1:通過ICPmax/MAP評估每組大鼠的勃起功能。

(2)免疫組化

去勢組大鼠海綿體組織中DNMT1、DNMT3a和DNMT3b的表達水平顯著低于假手術組和去勢+睪酮替代組。糖尿病組大鼠海綿體組織中DNMT1、DNMT3a和DNMT3b的表達水平顯著高于正常血糖組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組。

圖2:免疫組化檢測大鼠海綿體組織中 DNMT1 、 DNMT3a 和 DNMT3b 的表達水平。

(3)Western blotting

去勢組大鼠海綿體組織中DNMT1、DNMT3a、DNMT3b和eNOS的表達水平顯著低于假手術組和去勢+睪酮替代組。糖尿病組大鼠海綿體組織中DNMT1、DNMT3a和DNMT3b的表達水平顯著高于正常血糖組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組,而eNOS表達水平顯著降低。

圖3:Western blotting檢測DNMT1、DNMT3a、DNMT3b和eNOS的表達水平。

(4)eNOS 中啟動子區域的甲基化測序

去勢組大鼠海綿體組織中eNOS啟動子區域的甲基化水平與假手術組和去勢+睪酮替代組之間無顯著差異。糖尿病組大鼠海綿體組織中eNOS啟動子區域的甲基化水平顯著高于正常血糖組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組。

圖4:通過靶基因DNA甲基化測序(Target-BS)檢測了eNOS啟動子區域的甲基化水平。

  1. 假手術組、去勢組和去勢+睪酮(cast+T)組eNOS啟動子區域甲基化水平圖表;

  2. 正常血糖組、糖尿病組和糖尿病+甲基轉移酶抑制劑組eNOS啟動子區域甲基化水平圖表;

(C-D) eNOS啟動子區域甲基化水平的統計圖表。

易小結

本研究揭示了低雄激素狀態和1型糖尿病對大鼠陰莖海綿體組織中eNOS基因啟動子區域甲基化水平的不同影響。糖尿病通過上調甲基轉移酶水平和增加eNOS啟動子區域的甲基化,抑制eNOS表達和NO水平,進而導致ED。甲基轉移酶抑制劑能夠部分改善糖尿病大鼠的勃起功能,但其效果有限。未來的研究應進一步探索2型糖尿病對eNOS甲基化的影響,并開發更具選擇性甲基化調控策略,以實現靶向ED的精準治療。

Target-BS技術在本研究中的重要作用

Target-BS技術在本研究中用于檢測eNOS啟動子區域的甲基化水平。該技術通過設計特異性引物、DNA亞硫酸鹽轉化、目標基因甲基化擴增、PCR產物文庫構建和文庫質量控制測序等步驟,精確測量了eNOS啟動子區域的甲基化狀態。研究結果表明,糖尿病組大鼠海綿體組織中eNOS啟動子區域的高甲基化水平與eNOS表達水平的顯著降低密切相關,而甲基轉移酶抑制劑(5-aza-dc)能夠部分逆轉這種甲基化狀態,從而改善勃起功能。這一發現揭示了DNA甲基化在糖尿病引發的ED中的關鍵作用,并為開發靶向eNOS甲基化的治療策略提供重要依據。

易基因:DNA甲基化研究基本思路

DNA甲基化一般遵循四個步驟:

首先,進行整體全基因組甲基化變化的分析,包括平均甲基化水平變化、甲基化水平分布變化、降維分析、聚類分析、相關性分析等。

其次,進行甲基化差異水平分析,篩選具體差異基因,包括DMC/DMR/DMG鑒定、DMC/DMR在基因組元件上的分布、DMC/DMR的TF結合分析、時序甲基化數據的分析策略、DMG的功能分析等。

再次,將甲基化組學&轉錄組學關聯分析,包括Meta genes整體關聯、DMG-DEG對應關聯、網絡關聯等。

最后,對篩選出的目標區域DNA甲基化進行驗證,通常采用靶基因重亞硫酸鹽測序(Target-BS)。

關于易基因靶基因DNA甲基化測序(Target-BS)

對目標基因/CpG 位點甲基化檢測,建立靈活的靶向甲基化測序技術。易基因建立的靶基因甲基化高通量測序(Target Bisulfite sequencing,Target-BS)是針對已有目標基因panel組合,運用易基因自主研發的甲基化特異性多重PCR引物設計軟件,對亞硫酸鹽轉化后的目標基因多重擴增,建庫后進行超高深度(1000X以上)甲基化精準檢測。

應用方向:

Target-BS廣泛用于已知位點的甲基化Biomarker篩選、驗證及臨床轉化應用

  • 后續目標基因的甲基化驗證

技術優勢:

  • 多基因多重擴增,檢測通量高;

  • 超高深度亞硫酸鹽甲基化測序,相對于傳統BSP克隆測序,檢測靈敏度、準確性高,可準確檢測到樣本中低于1%的甲基化水平;

  • 樣本需求量低,20ng基因組DNA可實現多基因擴增;

  • 適用范圍廣,對基因組DNA、FFPE樣本、游離cfDNA等樣本均適用;

  • 檢測費用顯著低于現有技術、快周期、超高性價比。

易基因提供全面的表觀基因組學(DNA甲基化、DNA羥甲基化、cfDNA)和表觀轉錄組學(m6A、m5C、m1A、m7G、ac4C、RNA與蛋白互作)、DNA與蛋白互作及染色質開放性技術方案(ChIP-seq、ATAC-seq),詳詢易基因:0755-28317900。

參考文獻:

Wang N, Jiang Q, Xie L, Cheng B, Liu QW, Jiang R. Methylation of eNOS in the rat penile corpus cavernosum under different pathological states and its relationship with erectile function. Andrology. 2023 May 24. doi: 10.1111/andr.13465.

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